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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
“龙虾之都”盱眙“旅游护照”首发南京******
中新网南京1月10日电 (记者 泱波)一只只麻辣可口的盱眙十三香龙虾、一件件精美的盱眙文物、一幅幅漂亮的盱眙山水画……10日，“龙虾之都”盱眙在南京门东老街启动“十城十万盱眙旅游护照”发放活动，盱眙县委书记邓勇当起全县“首席推销员”，向来往民众热情地吆喝：“盱眙是个好地方，好山好水好风光，有诗有景有远方，欢迎大家来玩！”同时把盱眙“旅游护照”递出，发出诚挚邀约。
“龙虾之都”盱眙在南京启动“十城十万盱眙旅游护照”发放活动。 泱波 摄盱眙“旅游护照”整合盱眙文化探秘、民俗体验、美食养生、休闲娱乐等多个文旅项目，是盱眙继龙虾旅游金卡之后的又一惠民举措，目的是刺激文旅消费的复苏、提振旅游市场信心。盱眙“旅游护照”持有人到盱眙景区景点游玩时享受免门票优惠。
盱眙龙虾声名远播。 泱波 摄当天，在南京博物院盱眙“旅游护照”发放现场，盱眙县县长孙志标向记者透露，盱眙境内发现的大云山汉王陵遗址由南京博物院考古发掘，共挖掘、修复文物一万余件，目前已移交至盱眙大云山汉王陵博物馆，该馆将于1月12日对外开放，系统、直观地展示大云山汉王陵考古发掘和研究成果，以及盱眙地域历史文化特色。
盱眙文旅现场展示。 泱波 摄据悉，近年来盱眙出台了一系列促进文旅消费的政策，建设了一批如第一山历史文化街区、江淮剧场等重大文旅项目，不断丰富演出、研学、康养等各种类型的文旅消费业态，努力打造四时可游、四季能游、四处宜游的旅游目的地。(完)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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